Панатинайкос ще се изправи срещу български отбор в евротурнирите за шести път в своята история, но балансът в момента е изравнен. Отборът два пъти е бил елиминиран от български отбори и двата пъти срещу ЦСКА, а след това побеждава два пъти първо Пирин, а след това и Литекс.

Първият път е през сезон 1972-1973, когато съперник е ЦСКА, който отново елиминира гърците. ЦСКА продължава серията си и през сезон 1988-1989, когато се справя с гърците в КНК.

Краят на лошата серия за гърците срещу български отбори приключва през сезон 1994-1995 в КНК, когато е елминиран Пирин и тогава Панатинайкос  за първи път елиминират българи.

За последно Панатинайкос игра срещу български отбор през сезон 2002-2003 в Купата на УЕФА, когато гърците се справят след продължения с Литекс. Така сблъсъкът срещу Ботев ще е общо пети за ПАО срещу български тимове. 

Ето и всички резултати между български отбори и Панатинайкос:

1972-1973 КЕШ Панатинайкос - ЦСКА 0:2 и 1:2

1988-1989 КНК Панатинайкос - ЦСКА 0:1 и 0:2

1994-1995 КНК Панатинайкос - Пирин 6:1 и 2:0

2002-2003 Купа на УЕФА Панатинайкос - Литекс 2:1 и 1:0 след продължение